Bonjour zamzam, :D
Tu peux utiliser ce type de joint, que l'on trouve dans les entreprises de fournitures automobiles pour professionnels:

C'est du joint carrossier polyuréthane, donc compatible avec l'apprêt (mais tu peux aussi l'appliquer sur une couche d'apprêt époxy)
Pour l'application, c'est avec un pistolet à cartouche normal; puis tu applatis le boudin avec le doigt ou avec un vieux pinceau plat dont tu coupes les poils à mi hauteur.
Exemple sur le châssis, pour étanchéifier les pliures:

On peut le poncer grossièrement après séchage, mais le plus simple est de l'appliquer bien proprement du premier coup.
Puis il faut repasser une couche d'apprêt
Espérant t'avoir été utile :D